Chloroflexota
| Domaine | Bacteria |
|---|---|
| Règne | Bacillati |
- Chloroflexota Whitman et al. 2018
- Chloroflexaeota Oren et al. 2015
- Chlorobacteria Cavalier-Smith 2006
- Chloroflexi Garrity & Holt 2001
Les Chloroflexota (anc. Chlorobacteria, en français les Chlorobactéries) sont un phylum du règne des Bacillati au sein du domaine Bacteria. Son nom provient de Chloroflexus qui est le genre type de ce phylum.
Certains auteurs pensent que ce phylum pourrait être l'un des plus anciens existant encore.
Historique
T. Cavalier-Smith a fait des Chlorobacteria l'un des phylums de sa classification[2]. Il est possible que ce soit le phylum bactérien le plus ancien qui existe encore à l'heure actuelle[3] : la racine de l'arbre du vivant pourrait donc se trouver parmi les chlorobactéries ou bien entre les chlorobactéries et le reste du vivant.
Les chlorobactéries tirent leur nom du genre Chloroflexus, qui a également donné son nom à la classe des Chloroflexia. Les chlorobactéries possèdent des métabolismes variés même si le plus typique est la photohétérotrophie anoxygénique des chloroflèxes. En 2021, Oren et Garrity rectifient la nomenclature des phyla bactériens et parmi ceux-ci celui des chlorobactéries qui deviennent les Chloroflexota[1].
Taxonomie
Étymologie
L'étymologie de ce phylum Chloroflexota est la suivante : Chlo.ro.fle.xo’ta N.L. masc. n. Chloroflexus, genre type de ce phylum; N.L. neut. pl. n. suff. -ota, suffixe pour définir un phylum; N.L. neut. pl. n. Chloroflexota, le phylum des Chloroflexus[1],[4].
Liste de classes
Selon la LPSN (22 avril 2025)[5] ce phylum contient huit classes publiées de manière valide :
- Anaerolineae Yamada et al. 2006
- Ardenticatenia Kawaichi et al. 2013
- Caldilineae Yamada et al. 2006
- Chloroflexia corrig. Gupta et al. 2013
- Dehalococcoidia Löffler et al. 2013
- Ktedonobacteria corrig. Cavaletti et al. 2007
- Tepidiformia Kochetkova et al. 2020
- Thermoflexia Dodsworth et al. 2014
"Candidatus"
Selon la LPSN (11 novembre 2022)[6], cinq classes candidatus ont été décrites mais leur nom est invalide car elles n'ont pas été publiées de manière conforme au Code International de Nomenclature Bactérienne :
- « Ca. Bathosphaeria » Mehrshad et al. 2018
- « Ca. Limnocylindria » Mehrshad et al. 2018
- « Ca. Thermofontia » corrig. Ward et al. 2018
- « Ca. Uliximicrobiia » corrig. Williams et al. 2024
- « Ca. Umbricyclopia » Mehrshad et al. 2018
Controverse sur leur structure
Les chlorobactéries sont traditionnellement considérées comme des bactéries Gram négative à structure bimembranée. Il semblerait pourtant que certains membres aient une structure unimembranée[7], ce qui jette le doute sur la monophylie de ce taxon.
Position phylogénétique supposée
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Notes et références
- Oren et Garrity 2021, p. 3.
- ↑ Thomas Cavalier-Smith, 1998. A revised six-kingdom system of life. Biol. Rev. 73: 203-266.
- ↑ Thomas Cavalier-Smith, 2006. Rooting the tree of life by transition analyses. Biol Direct. ; 1: 19. doi: 10.1186/1745-6150-1-19
- ↑ (en) « Phylum Chloroflexota », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (consulté le ).
- ↑ List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 22 avril 2025.
- ↑ List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 11 novembre 2022.
- ↑ (en) Iain C. Sutcliffe, « A phylum level perspective on bacterial cell envelope architecture », Trends in Microbiology, vol. 18, no 10, , p. 464-470 (DOI 10.1016/j.tim.2010.06.005).
Bibliographie
- (en) A Oren et GM Garrity, « Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 71, no 10, , p. 005056 (DOI 10.1099/ijsem.0.005056)
Liens externes
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