Xanthomonas translucens
| Domaine | Bacteria |
|---|---|
| Sous-règne | Negibacteria |
| Embranchement | Proteobacteria |
| Classe | Gammaproteobacteria |
| Ordre | Xanthomonadales |
| Famille | Xanthomonadaceae |
| Genre | Xanthomonas |
Xanthomonas translucens est une espèce de proteobactéries de la famille des Xanthomonadaceae. Ce sont des bactéries phytopathogènes dont il existe de nombreuses souches, ou pathovars, responsables de diverses maladies des plantes, en particulier la maladie des stries bactériennes (ou glume noire des céréales) causée par Xanthomonas translucens pv. translucens et le flétrissement bactérien des graminées, causé par Xanthomonas translucens pv graminis.
Liste des non-classés
- Xanthomonas translucens DAR61454
- Xanthomonas translucens pv. arrhenatheri (Egli & Schmidt 1982) Vauterin & al. 1995
- Xanthomonas translucens pv. cerealis
- Xanthomonas translucens pv. graminis
- Xanthomonas translucens pv. hordei
- Xanthomonas translucens pv. phlei
- Xanthomonas translucens pv. phleipratensis
- Xanthomonas translucens pv. pistacia
- Xanthomonas translucens pv. poae
- Xanthomonas translucens pv. secalis
- Xanthomonas translucens pv. translucens
- Xanthomonas translucens pv. undulosa
Séquençage du génome
Les génomes de nombreuses souches et pathovars de Xanthomonas translucens ont été séquencés, fournissant des informations importantes sur la diversité génétique, l'évolution et les mécanismes de virulence de ce pathogène. La première séquence complète du génome d'une souche pathotype, X. t. pv. translucens DSM 18974T, a été publiée en 2016.[3] Ce travail a été suivi en 2022 par un projet d'envergure qui a publié les génomes complets des dix autres souches pathotypes de X. translucens, élargissant considérablement les ressources génomiques pour cette espèce.[4]
En 2022, le premier génome complet d'une souche sud-américaine, X. translucens pv. undulosa MAI5034, a été publié. Cette souche a été isolée sur du blé en Uruguay. La construction de la banque d'ADN et le séquençage pour ce projet ont été réalisés en Belgique.[5] La séquence est disponible dans la base de données GenBank.[6]
Notes et références
- ↑ Integrated Taxonomic Information System (ITIS), www.itis.gov, CC0 https://doi.org/10.5066/F7KH0KBK, consulté le 4 août 2018.
- ↑ NCBI, consulté le 4 août 2018.
- ↑ Sebastian Jaenicke, Daniel Wibberg, Alfred Pühler, Jörn Wissing, Jürg E. Frey et Kerstin Schneeberger, « Complete Genome Sequence of the Xanthomonas translucens pv. translucens Pathotype Strain DSM 18974T », Journal of Biotechnology, vol. 220, , p. 25-26 (PMID 26775681, DOI 10.1016/j.jbiotec.2016.01.009)
- ↑ Gael Goettelmann, Damien Richard, Alain Jauneau, Jonathan M. Jacobs, Estelle López-Soriano, Jillian M. Lang, Amadou Bah, Sébastien Carrère et Ralf Koebnik, « Complete Genome Sequences of the 10 Pathotype Strains of Xanthomonas translucens », Phytopathology, vol. 112, no 10, , p. 2149–2152 (PMID 35552697, DOI 10.1094/PHYTO-12-21-0524-A)
- ↑ « Partenaire de séquençage OHMX.bio »
- ↑ María I. Siri, Lucía Gutiérrez, Florencia Bertola, Jessica Schachterle, Julieta Languasco, Douglas James, Alejandro Tozzini, Patrick Hayes et Fernando Vilaró, « First Complete Genome Sequence of a South American Strain of Xanthomonas translucens pv. undulosa, the Causal Agent of Bacterial Leaf Streak of Wheat », Phytopathology, vol. 112, no 10, , p. 2153–2156 (PMID 35535875, DOI 10.1094/PHYTO-01-22-0025-A)
Liens externes
- (en) BioLib : Xanthomonas translucens (ex Jones, Johnson & Reddy 1917) Vauterin, Hoste, Kersters & Swings 1995 (consulté le )
- (en) Catalogue of Life : Xanthomonas translucens (ex Jones et al., 1917) Vauterin et al., 1995 (consulté le )
- (fr + en) ITIS : Xanthomonas translucens (ex Jones & al., 1917) Vauterin & al., 1995 (consulté le )
- (en) NCBI : Xanthomonas translucens "" Jones & al. 1917 (taxons inclus) (consulté le )
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