Sur piste, Filip Prokopyszyn remporte un certain nombre de médailles aux championnats du monde et d'Europe à partir de 2017 chez les juniors et chez les moins de 23 ans, principalement dans les disciplines de courses en peloton telles que le scratch, la course à l'élimination et la course à l'américaine. Il court pour le club de sa ville natale Trasa Zielona Góra jusqu'en 2018, puis pour le club de Tarnovia de Tarnowo Podgórne[2], avant de décrocher un contrat avec l'équipe continentale Mazowsze Serce Polski à partir de la saison 2021[3].
À partir de 2019, il est également régulièrement actif pour l'équipe nationale dans des compétitions internationales chez les élites. Il remporte une médaille d'argent sur le scratch des Jeux européens de 2019 et le bronze de la course à élimination aux championnats d'Europe de la même année. Il est champion de Pologne sur piste à plusieurs reprises entre 2019 et 2023.